Den 1. januar 2007 blev NGH statsligt selvejende. Det betyder, at skolen ledes af en professionel bestyrelse på 11 medlemmer, hvoraf de 9 har stemmeret.
Bestyrelsesvedtægterne er offentliggjort den 6. august 2020 og findes her.
Skolens bestyrelse er sammensat således:
Annemette Palmqvist
Bestyrelsesformand
Cand.scient. & ph.d. på RUC
Prodekan for uddannelse, Institut for Naturvidenskab og Miljø
Prodekan for uddannelse, Miljødynamik
Elevrepræsentanter
Næstformand Charlie Lund Friis, 2.z og elevrådsformand Sebastian Aarslev Jensen, 1.p.